IGA Istituto di Genomica applicata

IGA Istituto di Genomica applicata è un centro privato senza scopo di lucro per la ricerca nel campo della genetica, della genomica e della bioinformatica. Fornisce soluzioni innovative per l’agricoltura e la ricerca medica. L’istituto ha diversi obiettivi:

• migliorare le colture per il progresso dell’agricoltura, della silvicoltura e dell’industria alimentare
• esplorare la diversità genetica e comprendere le basi della variazione naturale
• sviluppare biotecnologie verdi
• sensibilizzare l’opinione pubblica sulla sicurezza e la protezione alimentare
• utilizzare tecnologie di sequenziamento e bioinformatica a supporto delle équipe mediche

La sede centrale di IGA Istituto di Genomica applicata e i laboratori si trovano presso il Parco Scientifico e Tecnologico Luigi Danieli a Udine. La struttura del wet lab è organizzata in tre aree:

• laboratori di preparazione dei campioni
• laboratori dell’RNA
• laboratorio di sequenziamento

Il laboratorio di sequenziamento è dotato di due sequenziatori Illumina HiSeq2500 e un sequenziatore Sanger ABI 3730XL. La struttura computazionale  dispone di unità per l’archiviazione dati fino a 300 TB e più di 200 core cpu, organizzate in tre aree:

• Informatica – iI core della CPU sono disponibili su server blade e montati su rack ad alte prestazioni ed efficienza energetica; gli host di virtualizzazione sono server blade ad alte prestazioni completamente ridondanti; i servizi interni ed esterni (autenticazione, posta elettronica, browser del genoma, condivisione dei dati) vengono eseguiti su macchine virtuali
• Magazzinaggio – cluster di archiviazione scalabile per database del genoma (140 TB); sistemi di storage utilizzati dai servizi di sistema virtualizzati (30TB); archiviazione ad alta velocità per il buffering di calcolo dei dati di sequenziamento (45TB); spazio di archiviazione ad alta capacità per archivi sequenziali (120 TB); sistema di archiviazione di backup
• Sicurezza dei dati e della rete – topologia di rete interna da 10 Gbps completamente ridondante; firewall ridondanti con servizi di sicurezza e UTM